Isolement et caractérisation de bactéries sulfurogènes à partir de biofilms formés sur matériaux métalliques en eau de mer naturelle

Isolating and characterizing sulphurogenous bacteria from biofilms formed on metallic materials in natural seawater

¹ Laboratoire CORRODYS, CRITT BNC rue Louis Aragon, BP 6, 50130 Octeville, France
² 2 Unité Biodiversité des Bactéries Pathogènes Emergentes, Institut Pasteur, 28 rue du Dr. Roux, 75015 Paris, France

Résumé

Les micro-organismes et particulièrement les bactéries anaérobies jouent un rôle important dans la biodétérioration des matériaux métalliques par la formation d'un biofilm. Les bactéries les plus impliquées dans cette biodétérioration (dans des conditions anoxiques) sont les bactéries sulfurogènes. Les plus étudiées à ce jour sont les bactéries sulfato-réductrices (BSR) et les bactéries thiosulfato-réductrices (BTR). Peu de données sont disponibles actuellement dans la littérature quant à l'isolement de telles souches dans les biofilms formés sur les aciers en eau de mer naturelle. Il a été possible d'isoler et de caractériser, à partir d'un biofilm formé sur acier au carbone et sur acier inoxydable, des bactéries sulfurogènes capables de produire des ions sulfure en anaérobiose. Une première étude a été réalisée sur la culture et l'analyse physiologique des bactéries isolées à partir d'un milieu d'enrichissement adapté au métabolisme des BTR. Par la suite, une seconde étude basée sur le séquençage du gène de l'ARNr 16S a confirmé et complété l'identification des espèces bactériennes isolées. Vingt cinq clones ont été étudiés et caractérisés comme appartenant essentiellement à la famille des Enterobacteriaceae, famille phylogénétiquement très éloignée des BSR et des BTR.

Abstract

Micro-organisms and especially anaerobic bacteria play an important role in microbially induced corrosion (MIC) on metallic material through the biofilm formation. The bacteria that are the most frequently involved in MIC phenomena under anoxic conditions are the sulfurogeneous bacteria. Among sulfurogeneous bacteria, the most frequently studied are the sulfate-reducing bacteria (SRB) and thiosulfate-reducing bacteria (TRB). These bacteria are the most aggressive against metallic materials in natural seawater. Only a few data (concerning thiosulfate-reducing bacteria isolated from marine biofilm formed on steel) are available in the literature. So that, we have isolated and characterized sulfurogeneous bacteria by qualitative analysis (based on morphological and physiological analysis, 16S rRNA gene sequencing) of marine biofilm formed on carbon steel or stainless steel AISI 316. By this way, 25 sulfurogeneous bacteria have characterized, which are able to produce sulfides in anoxic conditions. These bacteria have been mainly characterized as belonging to the family of Enterobacteriaceae. The family of Enterobacteriaceae is phylogenetically distant from SRB and TRB.