Issue |
Matériaux & Techniques
Volume 98, Number 1, 2010
Numéro Thématique : Biodétérioration de matériauxTopical Issue: Biodeterioration of materials |
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Page(s) | 69 - 79 | |
Section | Numéro Thématique : Biodétérioration de matériaux / Topical Issue: Biodeterioration of materials | |
DOI | https://doi.org/10.1051/mattech/2010013 | |
Published online | 22 June 2010 |
Caractérisation de la flore microbienne associée aux phénomènes de corrosion marine : apport de la spectroscopie infrarouge à transformée de Fourier (IRTF)
Characterization of microbial flora associated with marine corrosion: the contribution of FT-IR spectroscopy
1
Équipe de Recherche en Physico-Chimie et Biotechnologies, Université Caen
Basse Normandie, 14032
Caen Cedex, France
e-mail : Nicolas.BOUDAUD@veolia.com ;
caroline.amiel@unicaen.fr
2
Corrodys, centre de corrosion marine et biologique,
55 rue de Beuzeville,
50120
Equeurdreville-Hainneville,
France
Reçu :
10
Novembre
2008
Accepté :
19
Février
2010
Une approche polyphasique a été utilisée pour étudier la flore cultivable anaérobie associée aux phénomènes de corrosion induite par les microorganismes (CIM). Parmi cette flore, les bactéries sulfato-réductrices (BSR) et les bactéries thiosulfato-réductrices (BTR) sont décrites comme étant particulièrement agressives vis-à-vis des matériaux métalliques immergés en eau de mer, notamment à cause de leur capacité à produire du sulfure de dihydrogène (H2S). Les spectres IR de 22 BSR et BTR de collection ont été enregistrés afin de créer une spectrothèque de référence. Pour ce faire, un milieu de culture minimum commun (MCM) a été développé afin de permettre la croissance concomitante des BSR et des BTR et de permettre la comparaison de leurs spectres IR. Les résultats de la classification IRTF de ces souches ont abouti à une discrimination nette au niveau genre et espèce. Les spectres IR d’isolats issus de coupons en acier carbone immergés durant une année dans 3 zones portuaires françaises ont été comparés à la spectrothèque préalablement créée. Leur identification et l’image de leur biodiversité ont été décrites en associant les résultats spectroscopiques et le séquençage du gène de l’ARN 16S de quelques souches représentatives. Dans cette étude, la population dominante est constituée de souches appartenant au genre Vibrio. Des souches appartenant aux genres Desulfovibrio (BSR) et à l’ordre des Clostridiales ont également été retrouvées. Dans l’ensemble, l’approche polyphasique combinant spectroscopie IRTF et méthode moléculaire a permis l’étude taxonomique et écologique de la flore bactérienne cultivable sur MCM associée à la CIM.
Abstract
In this study, a polyphasic approach was used to study bacteria associated with biocorrosion processes. Among these bacteria Sulfate-Reducing Bacteria (SRB) and Thiosulfate-Reducing Bacteria (TRB) are described to be aggressive against metallic materials, notably via hydrogen sulfide release. In order to study this particular flora, an infrared spectra library of 22 SRB and TRB collection strains was created using a newly developed common minimum culture medium (CMM) and standardized culture conditions. The CMM developed during this study laboratory proved its abiliy to allow for growth of both of SRB and TRB strains. Concerning FT-IR spectroscopy results, these sulfurogen collection strains were clearly discriminated and differentiated at the genus and species level. Infrared spectra of biofilm isolates, recovered from biofilms formed on carbon steel coupons immersed for one year in 3 different French harbour areas, were compared to the infrared reference spectra library. The biodiversity of the biofilm isolates was describe using help of 16S rRNA sequencing and indicated that strains belonging to the Vibrio genus were the dominant population, strains belonging to the Desulfovibrio genus (SRB) and Clostridiales order were also identified. Overall, the combination of the FT-IR spectroscopy and molecular approaches allowed for the taxonomic and ecological study of a bacterial flora, cultivating on CMM, associated with Microbiology Induced Corrosion (MIC) processes.
Mots clés : Bactéries sulfurogènes / corrosion marine / spectroscopie IRTF
Key words: Sulfurogene bacteria / marine corrosion / FT-IR spectroscopy
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